Category Archives: Studentprosjekter

TangloppeTorsdag: avslutning av studentprosjekt.

I løpet av dette semesteret har Christine vært med på NorAmph-prosjektet. En av oppgavene har vært at hun skulle skrive blogger om hvordan det har vært å være på museet og ha studentprosjekt her. Dette er Christines avslutningsblogg, nå er det bare oppgaveskriving igjen…


Hei igjen!

Paramphitoe hystrix - fotografert før innsending til barcoding med NorBOL hos BOLD. Foto: C Østensvig

Paramphitoe hystrix – fotografert før innsending til barcoding med NorBOL hos BOLD. Foto: C Østensvig

For noen måneder siden skrev jeg et blogginnlegg der jeg fortalte at jeg dette semesteret skulle være med Anne Helene på hennes prosjekt om barkoding av amfipoder, blogginnlegget finner du her.

Dette semesteret er nå forbi, og sommeren står og banker på døren. I løpet av de siste 5 månedene har jeg fått ta del i hele prosessen fra man henter inn prøver til man får tilbake resultater av barkoding, og alt innimellom. Det har vært et svært lærerikt semester med mange nye ting å bli kjent med.

På grunn av tidspress for å få sendt inn prøvene til barkodingen, startet vi semesteret med å gjøre dette. Her plukket vi ut 95 ulike individer som var indentifiserte. Vi tok bilder som skulle følge prøvene til barkodingen, og vi registrerte de i samlingene til universitetsmuseet. Etter dette reiste vi på tokt til Raunefjorden der vi hentet inn prøvene (dette kan du lese mer om i blogginnlegget over).

Når vi kom tilbake fra tokt ble prøvene først sortert ned til fylum, med unntak av krepsdyrene, som jeg identifiserte ned til orden. Til slutt sorterte jeg amfipodene ned til familier.

På slutten av semesteret fikk vi tilbake resultatene fra barkodingen. Der var mye interessant å hente fra disse, blant annet var flere individene vi trodde var samme art var muligens ikke det, og vi så også noen individer som var identifisert til ulike arter som potensielt kan være den samme.

En første kikk på resultatene fra barcodingen.

En første kikk på resultatene fra barcodingen.

I dette prosjektet har jeg innsett at barkoding er en veldig viktig prosess som kan gi oss mye informasjon, og enklere tilgang på denne informasjonen. Ved å skape en offentlig database med alle barkodete arter i, kan man enklere finne frem til arter og informasjon om disse. Det har vært veldig artig å få ta del i et prosjekt som er en del av en større sammenheng.

Gjennom tiden min på universitetsmuseet har jeg lært utrolig mye. Jeg har lært mye om ulike biologiske metoder på lab, og ikke minst mye om den spennende gruppen amfipoder. Og som student er det deilig å kunne få et avbrekk fra det å gå på forelesninger hele tiden, så det har vært utrolig deilig å få litt praktisk arbeide inn i hverdagen. Og ikke minst har dette prosjektet gjort meg mer nysgjerrig! Forhåpentligvis får jeg muligheten til å få komme tilbake å fortsette med dette!

Christine

 

TangloppeTorsdag: bunnlevende dyr for oss og andre?

To glade RP-innsamlere. Foto: A. Hosia

To glade RP-innsamlere. Foto: A. Hosia

En del av NorAmph-prosjektet er knyttet til utdanning av nye ”amfipodologer” – vi er få i Norge som jobber med identifisering av amfipoder. Noen av oss var samlet på Espegrend til en workshop i september, men vi er alltid glade for å utvide gjengen! Dette halvåret er derfor Christine med meg en dag i uken, og her skal hun få presentere begynnelsen av prosjektet sitt. Resultatene fra Christine sine strekkode-DNA-undersøkelser vil bli en del av NorBol.

Anne Helene

 

Hei!

Christine på F/F Hans Brattstrøm. Foto: AHS Tandberg

Christine på F/F Hans Brattstrøm. Foto: AHS Tandberg

Jeg heter Christine Østensvig, er 22 år gammel og kommer fra Halden. Jeg er student ved biologi på UiB, og dette semesteret er jeg med på Anne Helene sitt prosjekt som omhandler barcoding av amfipoder.

Jeg syns dette prosjektet har vært utrolig spennende så langt, og fredag 10 februar reiste vi på tokt for å samle noen tanglopper til prosjektet. Vi reiste sammen med Aino og Luis som skulle samle pelagiske hydrozoa til sitt prosjekt. Turen gikk fra Espegrend til Raunefjorden, Korsfjorden og Fanafjorden og tilbake igjen.

RP-sleden er klar til bruk! Foto: C. Østensvig

RP-sleden er klar til bruk! Foto: C. Østensvig

Vi samlet inn vår prøve i Raunefjorden. For å samle inn prøven brukte vi en RP-slede, som er et redskap for å ta prøver av epi-bentiske dyr. Epi-bentiske dyr er de dyrene som bor like over havbunnen.

Videre vasket vi prøven gjentatte ganger for å få fram dyr fra ulike sjikt – vi ønsket å skille de lette dyrene som bor i overgangen mellom havbunn og sjøvann fra de dyrene som bor nedi havbunnen. Metoden vi brukte kalles ”dekantering” – da bruker vi masse vann til å forsiktig løsne de lette dyrene, og så heller vi det over en sikt så vi kan ta vare på dyrene. Vi var litt ekstra uheldige denne gangen, da prøven vår var fulle av slimåler som slimet ned hele prøven vår, men det tok vi et med smil! Vi plukket slimålene ut så fort som mulig, og da ble resten av prøven, og spesielt ”dekanten” veldig fin.

 

Et helt glass fullt av spennende dyr for Aino og Luis! Foto: AHS Tandberg

Et helt glass fullt av spennende dyr for Aino og Luis! Foto: AHS Tandberg

Vi fikk mange spennende dyr i prøven vår, og vi fant masse amphipoder! I tillegg fant vi en haug med epi-bentiske medusaer (maneter som bor like ved havbunnen) som Aino og Luis kunne bruke til sitt prosjekt! De kommer til å skrive om dette i en blogg om ikke så veldig lenge. Så vi fikk hjulpet de andre i tillegg til å artige saker til oss selv (og det fungerte kanskje som en liten takk for at vi fikk være med dem på tokt!)

Fjæreinnsamling! Mange spennende amfipoder rett under steinene! Foto: AHS Tandberg

Fjæreinnsamling! Mange spennende amfipoder rett under steinene! Foto: AHS Tandberg

 

Dagen ble avsluttet med litt graving og leting etter tanglopper i fjæra på Espegrend, og etter hvert fikk jeg grepet på å fange de der også! Dagen var utrolig lærerik, og det er litt artig, for hver gang jeg føler jeg har forstått tangloppenes verden, så dukker det opp noe helt nytt! Og det er jo det som er så gøy med biologi, man blir aldri helt klok på alt!

Christine

Makroalger til NorBOL

I forrige uke hang jeg meg på kurset i marin floristikk til institutt for biologi (BIO309A), som ble holdt ute på feltstasjonen vår i nærheten av Flesland. Det var en trivelig gjeng på 12 masterstudenter og tre undervisere i fra BIO (samt undertegnede) som jaktet på makroalger – studentene for å lære seg å identifisere dem, jeg for å sanke arter til NorBOL.

Arbeidsflyten var i) ut og samle alger (til fots og med båt, vi dekket ulike habitater og dybder) ii) inn på laben og identifisere iii) arter som ikke står på lista skal inn til Katrine for fotografering og vevsprøvetaking iv) resten av individet presses som en herbarievoucher.

Totalt tok vi 88 prøver av 76 arter, nå blir det veldig spennende å se hvilke resultater vi får!

Her blir det en litt annen tilnærming på sekvenseringen enn hva vi normalt gjør i NorBOL, da algene krever et annet oppsett enn det de har tilgjengelig på laben vi normalt bruker i Guelph i Canada. Derfor har vi alliert oss med the Saunders lab, som har sagt seg villige til å sekvensere for oss mot at de får bruke resultatene i forskningen sin – og ingenting er vel bedre enn at resultatene blir brukt, så det gikk vi villig med på!

Under vann

Under vann

Hva finner vi her?

Hva finner vi her?

Den spede begynnelsen på identifiseringene...

Den spede begynnelsen på identifiseringene…

...som ble til et imponerende antall arter på kursets siste dag!

…som ble til et imponerende antall arter på kursets siste dag!

Identifiseringsarbeid på laben

Identifiseringsarbeid på laben

Tavleundervisning er fint når en skal få oversikten på plass

Tavleundervisning er fint når en skal få oversikten på plass

Innsamling i fjæra

Innsamling i fjæra

Kjersti snakker om de ulike habitatene

Kjersti snakker om de ulike habitatene

Tøff dag på kontoret!

Tøff dag på kontoret!

Fjærepytter på Store Kalsøy

Fjærepytter på Store Kalsøy

Lettbåtfrakting over til holmen vi skal undersøke

Lettbåtfrakting over til holmen vi skal undersøke

Artsrikt!

Artsrikt!

Pent dandert voucheridivid på herbarieark

Pent dandert voucheridivid på herbarieark

Vouchere i press

Vouchere i press

På algejakt i Seløysundet

På algejakt i Seløysundet

Artsjakt

Artsjakt

Pelvetia canaliculata

Pelvetia canaliculata

Ceramium cf virgatum

Ceramium cf virgatum

Ulva lactua (havsalat)

Ulva lactua (havsalat)

Fucus serratus

Fucus serratus

Chaetomorpha aerea/linum

Chaetomorpha aerea/linum

Chylocladia verticilliata

Chylocladia verticilliata

Delesseria sanguinea

Delesseria sanguinea

Plocamium lyngbyanum

Plocamium lyngbyanum

Som zoolog klarte jeg ikke å la være å plukke med meg dyrene som levde på tare og tang, så det ble noen dyr til barcoding også!

Calliostoma zizyphinum, mangefarget kjeglesnegl

Calliostoma zizyphinum, mangefarget kjeglesnegl

ZMBN_106217 (8)

Isopod/tanglus

Isopod/tanglus

Aplysia punctata, sjøhare

Aplysia punctata, sjøhare

Det ble plukket en god del Amphipoder (tanglopper) til NorAmph

Det ble plukket en god del Amphipoder (tanglopper) til NorAmph

En skjellrygg (Polychaeta/børstemark)

En skjellrygg (Polychaeta/børstemark)

Vevsprøver

Vevsprøver

Takk til undervisere og studenter for en flott uke, vi krysser fingrene for gode resultater!

Fredagsbilde: Travel light..?

Det er feltkurstid igjen, og i dag har jeg pakket lasset som skal bli med meg ut på feltstasjonen – det er ikke rent lite en trenger om en skal være “klar for alt” vi måtte ende med å fange!
Uka står i algenes tegn, da det er kurset i marin floristikk som går, og målet er å ta to individer av hver algeart vi finner til NorBOL – men det sitter nok litt zoologi og venter på meg innimellom algene også 😉

Foredragsforberedelser, ny lærdom og ca halvparten av "flyttelasset"

Foredragsforberedelser, ny lærdom og ca halvparten av “flyttelasset”

Evertebratavdelingens julekalender!

Pagurus prideux kommer med gode nyheter

Pagurus prideux kommer med gode nyheter!

Vi har startet nedtellingen mot jul på den engelske versjonen av bloggen, hvor det etter planen skal komme en ny post hver dag fremover til julaften.

Vi ønsker med dette å få vist frem enda flere av de kule dyrene og de spennende problemstillingene vi arbeider med, og vi håper det faller i smak hos leserne våre.

At kalenderen ble på engelsk skyldes praktiske hensyn – men bildene er flotte selv om en ikke henger helt med i språket.

Alle postene vil bli å finne under kategorien “2015 december calendar” (klikk). Så langt har vi skrevet om vintertokt, og om grønne sjøsauesnegler… ta en titt!